Karın Ağrısı: Gluten intoleransının en yaygın semptomudur.
Baş Ağrısı: Gluten intoleransı olmayan bireyler migrene ve baş ağrısına daha yatkındır.
Yorgunluk: Özellikle gluten içeren besinler tükettikten sonra yorgunluk veya halsizliğe yatkınlık bir gluten intoleransı göstergesidir.
Cilt Sorunları: Dermatitis herpetiformis, çölyak hastalığının deri bulgusudur. Diğer bazı cilt hastalıkları da glütensiz diyetle iyileşebilir.
Depresyon: Gluten intoleransı olan kişilerde daha yaygındır. Sindirim sorunları olan kişiler, sağlıklı bireylere göre daha çok anksiyete ve depresyona yatkın görünmektedirler